Todos os textos são submetidos ao exame simultâneo de duas pessoas avaliadoras, integrantes do Conselho Científico ad hoc do periódico pelo sistema de avaliação cega (Double Blind Review). Nem as pessoas autoras nem avaliadoras terão seus nomes divulgados durante a avaliação. As pessoas avaliadoras possuem um prazo de até quatro semanas para emitirem um parecer favorável, desfavorável ou favorável sob condições de revisão. Uma terceira pessoa avaliadora pode ser consultada, caso haja divergência de opinião nos pareceres. Esta terceira pessoa avaliadora terá igualmente um prazo de até quatro semanas para emitir seu parecer.

A partir de 2024, a revista Estudos Teológicos adotou o formato de publicação em fluxo contínuo. Agora, os artigos são publicados assim que são aprovados e revisados através do processo de Double Blind Review. Com isso, os rigorosos critérios de avaliação e editoração são mantidos intactos, mas a mudança proporciona uma maior rapidez na divulgação dos artigos e dossiês já aprovados, garantindo uma disseminação ágil do conhecimento teológico.